Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RFTN1Q14699 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFTN1Q14699 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFTN1Q14699 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN1Q14699 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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