Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 22.9
PUM1Q14671 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 22.9
PUM1Q14671 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TNFAIP2-203ENST00000559195 572 ntTSL 520.49■□□□□ 0.872e-8■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.712e-8■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-8■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TNFAIP2-205ENST00000559406 1799 ntTSL 515.32■□□□□ 0.042e-8■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TNFAIP2-207ENST00000560562 1429 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.072e-8■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.514e-10■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 TOMM5-204ENST00000540941 3071 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-7■■■■□ 22.8
PUM1Q14671 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.977e-8■■■■□ 22.7
PUM1Q14671 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.395e-10■■■■□ 22.7
PUM1Q14671 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.225e-10■■■■□ 22.7
PUM1Q14671 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.253e-9■■■■□ 22.7
PUM1Q14671 COPE-207ENST00000597646 868 ntTSL 321.07■□□□□ 0.964e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 320.75■□□□□ 0.914e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.894e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.874e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.784e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 COPE-209ENST00000599964 542 ntTSL 418.41■□□□□ 0.544e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.444e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 MBD3-206ENST00000589901 740 ntTSL 217.56■□□□□ 0.44e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 515.37■□□□□ 0.054e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.254e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-209ENST00000437745 1711 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.34e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-204ENST00000415365 1405 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.494e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 KRT18-204ENST00000548015 928 ntTSL 211.86□□□□□ -0.513e-19■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-214ENST00000630952 1721 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.74e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.844e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 49.71□□□□□ -0.864e-6■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-207ENST00000433922 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.974e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-202ENST00000405202 1689 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.984e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-212ENST00000452975 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.984e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 BZW2-208ENST00000436868 1784 ntTSL 58.07□□□□□ -1.124e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 SLIRP-208ENST00000556956 450 ntTSL 23.95□□□□□ -1.784e-10■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-7■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 22.6
PUM1Q14671 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.366e-7■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 CLTC-213ENST00000584313 715 ntTSL 314.81□□□□□ -0.042e-14■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 ISY1-205ENST00000471497 1211 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.086e-7■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.256e-7■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 ISY1-207ENST00000496163 752 ntTSL 312.83□□□□□ -0.366e-7■■■■□ 22.5
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PUM1Q14671 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.136e-7■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 CLTC-204ENST00000472129 654 ntTSL 26.52□□□□□ -1.372e-14■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 FAM129A-202ENST00000417056 602 ntTSL 34.34□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 22.5
PUM1Q14671 DGCR8-210ENST00000498171 3661 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.637e-7■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 DRAP1-209ENST00000534333 453 ntTSL 219.34■□□□□ 0.699e-8■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 DRAP1-206ENST00000530791 837 ntTSL 217.81■□□□□ 0.449e-8■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.443e-7■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-7■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.411e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-201ENST00000264258 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 26.95□□□□□ -1.31e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.411e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.481e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RPL31-209ENST00000419276 781 ntTSL 55.43□□□□□ -1.541e-12■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 RBM25-208ENST00000530978 441 ntTSL 28.85□□□□□ -0.995e-11■■■■□ 22.4
PUM1Q14671 DCAF1-201ENST00000335891 4114 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.977e-9■■■■□ 22.3
PUM1Q14671 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.017e-9■■■■□ 22.3
PUM1Q14671 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.047e-9■■■■□ 22.3
PUM1Q14671 ARID1A-212ENST00000636219 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.79□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 22.3
PUM1Q14671 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 22.3
PUM1Q14671 RBBP4-219ENST00000531983 473 ntTSL 26.26□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 22.2
PUM1Q14671 RBBP4-210ENST00000475321 619 ntTSL 54.36□□□□□ -1.712e-7■■■■□ 22.2
PUM1Q14671 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 CDC37-208ENST00000590632 601 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-14■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 218.39■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.532e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 518.21■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-213ENST00000595897 2973 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.242e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 516.5■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.422e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 22.1
PUM1Q14671 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 320.59■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 22
PUM1Q14671 PTBP1-214ENST00000589575 749 ntTSL 313.66□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 22
PUM1Q14671 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 312.01□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 22
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