Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNF4GQ14541 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HNF4GQ14541 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HNF4GQ14541 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms