Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCOA4Q13772 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA4Q13772 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NCOA4Q13772 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCOA4Q13772 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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