Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMB3Q13751 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMB3Q13751 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB3Q13751 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMB3Q13751 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB3Q13751 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB3Q13751 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB3Q13751 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB3Q13751 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMB3Q13751 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMB3Q13751 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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