Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CACNA1SQ13698 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CACNA1SQ13698 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CACNA1SQ13698 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CACNA1SQ13698 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
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