Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB3Q13509 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB3Q13509 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB3Q13509 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB3Q13509 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms