Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNTA1Q13424 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNTA1Q13424 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNTA1Q13424 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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