Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCGB2A2Q13296 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCGB2A2Q13296 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCGB2A2Q13296 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms