Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALCOCO2Q13137 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CALCOCO2Q13137 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALCOCO2Q13137 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALCOCO2Q13137 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO2Q13137 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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