Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLFQ13129 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLFQ13129 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLFQ13129 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLFQ13129 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLFQ13129 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RLFQ13129 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLFQ13129 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLFQ13129 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RLFQ13129 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLFQ13129 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLFQ13129 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RLFQ13129 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RLFQ13129 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RLFQ13129 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RLFQ13129 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RLFQ13129 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RLFQ13129 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RLFQ13129 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RLFQ13129 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RLFQ13129 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RLFQ13129 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RLFQ13129 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RLFQ13129 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLFQ13129 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLFQ13129 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RLFQ13129 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLFQ13129 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLFQ13129 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLFQ13129 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RLFQ13129 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLFQ13129 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLFQ13129 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLFQ13129 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RLFQ13129 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLFQ13129 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLFQ13129 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLFQ13129 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLFQ13129 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RLFQ13129 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RLFQ13129 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RLFQ13129 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLFQ13129 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLFQ13129 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLFQ13129 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RLFQ13129 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLFQ13129 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLFQ13129 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLFQ13129 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RLFQ13129 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RLFQ13129 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RLFQ13129 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RLFQ13129 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLFQ13129 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLFQ13129 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RLFQ13129 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLFQ13129 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RLFQ13129 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLFQ13129 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RLFQ13129 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLFQ13129 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLFQ13129 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RLFQ13129 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLFQ13129 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLFQ13129 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RLFQ13129 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RLFQ13129 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RLFQ13129 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RLFQ13129 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLFQ13129 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RLFQ13129 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLFQ13129 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLFQ13129 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RLFQ13129 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RLFQ13129 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RLFQ13129 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLFQ13129 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RLFQ13129 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLFQ13129 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RLFQ13129 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RLFQ13129 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RLFQ13129 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLFQ13129 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RLFQ13129 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLFQ13129 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLFQ13129 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLFQ13129 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLFQ13129 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLFQ13129 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RLFQ13129 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLFQ13129 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLFQ13129 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLFQ13129 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLFQ13129 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RLFQ13129 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLFQ13129 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLFQ13129 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLFQ13129 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RLFQ13129 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RLFQ13129 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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