Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAF1Q13077 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAF1Q13077 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAF1Q13077 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAF1Q13077 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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