Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MKRN3Q13064 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MKRN3Q13064 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKRN3Q13064 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN3Q13064 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN3Q13064 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
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