Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXC1Q12948 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXC1Q12948 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXC1Q12948 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXC1Q12948 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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