Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXF2Q12947 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXF2Q12947 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF2Q12947 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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