Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC173Q0VFZ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC173Q0VFZ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC173Q0VFZ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms