Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RIPPLY1Q0D2K3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY1Q0D2K3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms