Protein–RNA interactions for Protein: Q08949

DDC1, DNA damage checkpoint protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDC1Q08949 CIA1YDR267C 993 nt7.32□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 LDB7YBL006C 543 nt7.32□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 PLB2YMR006C 2121 nt7.32□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 YMR074CYMR074C 438 nt7.32□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 GGC1YDL198C 903 nt7.3□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 YKL147CYKL147C 618 nt7.3□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.3□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 HTZ1YOL012C 405 nt7.29□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 CTF3YLR381W 2202 nt7.29□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 PMA2YPL036W 2844 nt7.29□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 YJL163CYJL163C 1668 nt7.28□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 ERR3YMR323W 1314 nt7.28□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 YOL046CYOL046C 675 nt7.28□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 APE4YHR113W 1473 nt7.28□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 PGI1YBR196C 1665 nt7.28□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 CMK2YOL016C 1344 nt7.27□□□□□ -1.24
DDC1Q08949 GNA1YFL017C 480 nt7.27□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 CDC7YDL017W 1524 nt7.27□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 ERG27YLR100W 1044 nt7.26□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 LIP5YOR196C 1245 nt7.26□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 BRN1YBL097W 2265 nt7.25□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 FIT2YOR382W 462 nt7.25□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 MSS51YLR203C 1311 nt7.25□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 COX15YER141W 1461 nt7.24□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 CYS4YGR155W 1524 nt7.24□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 YLR030WYLR030W 792 nt7.24□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 RPL43AYPR043W 279 nt7.24□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 YNR005CYNR005C 405 nt7.23□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 YOR041CYOR041C 432 nt7.22□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 HXT9YJL219W 1704 nt7.21□□□□□ -1.25
DDC1Q08949 YPR076WYPR076W 375 nt7.21□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 MAL31YBR298C 1845 nt7.2□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 GTS1YGL181W 1191 nt7.2□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 SRY1YKL218C 981 nt7.2□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 NTG2YOL043C 1143 nt7.2□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 FCY22YER060W-A 1593 nt7.2□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 CDC23YHR166C 1881 nt7.19□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 SSC1YJR045C 1965 nt7.19□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 PUS7YOR243C 2031 nt7.19□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 LIA1YJR070C 978 nt7.19□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 HOC1YJR075W 1191 nt7.19□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 YCR049CYCR049C 447 nt7.18□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 AGX1YFL030W 1158 nt7.18□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 YPL264CYPL264C 1062 nt7.18□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 MHP1YJL042W 4197 nt7.18□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 YIL108WYIL108W 2091 nt7.18□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 PPH21YDL134C 1110 nt7.17□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 PMP3YDR276C 168 nt7.17□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 YOL099CYOL099C 492 nt7.17□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 YAL045CYAL045C 309 nt7.16□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 ASR1YPR093C 867 nt7.16□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 FLC2YAL053W 2352 nt7.16□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 SMC5YOL034W 3282 nt7.15□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 PHO85YPL031C 918 nt7.15□□□□□ -1.26
DDC1Q08949 YLL058WYLL058W 1728 nt7.15□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 YIP4YGL198W 708 nt7.14□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 FMP40YPL222W 2067 nt7.13□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 MSB3YNL293W 1902 nt7.13□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 HEL1YKR017C 1656 nt7.13□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 GPD1YDL022W 1176 nt7.13□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 SUN4YNL066W 1263 nt7.13□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 NUP49YGL172W 1419 nt7.12□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 THR1YHR025W 1074 nt7.12□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 Q0010Q0010 387 nt7.12□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 NUP57YGR119C 1626 nt7.12□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 HPT1YDR399W 666 nt7.11□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 FCY2YER056C 1602 nt7.11□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 CTA1YDR256C 1548 nt7.11□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 CRH1YGR189C 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 EXG2YDR261C 1689 nt7.1□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 HXT13YEL069C 1695 nt7.1□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 AIM20YIL158W 615 nt7.1□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 MRPL35YDR322W 1104 nt7.09□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 YPR127WYPR127W 1038 nt7.09□□□□□ -1.27
DDC1Q08949 YCR061WYCR061W 1896 nt7.09□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 LCL3YGL085W 825 nt7.08□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 RPL2BYIL018W 765 nt7.08□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 AIM34YMR003W 597 nt7.08□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 CAN1YEL063C 1773 nt7.08□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 YNL040WYNL040W 1371 nt7.08□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 ICP55YER078C 1536 nt7.07□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.07□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 MRPL19YNL185C 477 nt7.07□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 MSC3YLR219W 2187 nt7.07□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 VBA5YKR105C 1749 nt7.07□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 AFG2YLR397C 2343 nt7.06□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 MSG5YNL053W 1470 nt7.06□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 YGL102CYGL102C 429 nt7.06□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 PRI1YIR008C 1230 nt7.06□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 REC107YJR021C 945 nt7.06□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 SPG5YMR191W 1122 nt7.06□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 LSC1YOR142W 990 nt7.06□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 PRC1YMR297W 1599 nt7.05□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 ASF1YJL115W 840 nt7.05□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 YLL056CYLL056C 897 nt7.05□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 YBR113WYBR113W 483 nt7.05□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 ENB1YOL158C 1821 nt7.05□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 YKR018CYKR018C 2178 nt7.05□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 RMD8YFR048W 1989 nt7.04□□□□□ -1.28
DDC1Q08949 OPI7YDR360W 435 nt7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.2 ms