Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 HTZ1YOL012C 405 nt7.91□□□□□ -1.14
DSE3Q08729 YJL163CYJL163C 1668 nt7.91□□□□□ -1.14
DSE3Q08729 MAM3YOL060C 2121 nt7.9□□□□□ -1.14
DSE3Q08729 HXT9YJL219W 1704 nt7.9□□□□□ -1.14
DSE3Q08729 CYS4YGR155W 1524 nt7.9□□□□□ -1.14
DSE3Q08729 RPL43AYPR043W 279 nt7.89□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 MAL31YBR298C 1845 nt7.89□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 MSS51YLR203C 1311 nt7.88□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 YPR076WYPR076W 375 nt7.88□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.87□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.87□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.87□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 YCR049CYCR049C 447 nt7.87□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 UFD1YGR048W 1086 nt7.86□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 AGX1YFL030W 1158 nt7.85□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 YOL099CYOL099C 492 nt7.85□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 FIT2YOR382W 462 nt7.85□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 APE4YHR113W 1473 nt7.85□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 CDC23YHR166C 1881 nt7.85□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 ECM10YEL030W 1935 nt7.84□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 GTS1YGL181W 1191 nt7.84□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 HOC1YJR075W 1191 nt7.84□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 NTG2YOL043C 1143 nt7.84□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 FCY22YER060W-A 1593 nt7.84□□□□□ -1.15
DSE3Q08729 SRY1YKL218C 981 nt7.82□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 EXG2YDR261C 1689 nt7.82□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 PPH21YDL134C 1110 nt7.81□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 MRPL35YDR322W 1104 nt7.81□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 LIA1YJR070C 978 nt7.81□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 CTA1YDR256C 1548 nt7.81□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 SSC1YJR045C 1965 nt7.8□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 YEL023CYEL023C 2049 nt7.8□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 GPD1YDL022W 1176 nt7.8□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 THR1YHR025W 1074 nt7.8□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 YAL045CYAL045C 309 nt7.8□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 COX15YER141W 1461 nt7.8□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 HPT1YDR399W 666 nt7.79□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 FLC2YAL053W 2352 nt7.79□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 NUP57YGR119C 1626 nt7.78□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 YLL058WYLL058W 1728 nt7.78□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 YGR139WYGR139W 339 nt7.78□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 SUN4YNL066W 1263 nt7.78□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 PHO85YPL031C 918 nt7.78□□□□□ -1.16
DSE3Q08729 FMP40YPL222W 2067 nt7.77□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 LPD1YFL018C 1500 nt7.77□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 YIP4YGL198W 708 nt7.76□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 ASR1YPR093C 867 nt7.76□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 RMD8YFR048W 1989 nt7.75□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 FCY2YER056C 1602 nt7.75□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 CAN1YEL063C 1773 nt7.75□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 YGL102CYGL102C 429 nt7.75□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 ICP55YER078C 1536 nt7.74□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 RPL2BYIL018W 765 nt7.74□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 NUP49YGL172W 1419 nt7.73□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 REC107YJR021C 945 nt7.73□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 YLL056CYLL056C 897 nt7.73□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 MSC3YLR219W 2187 nt7.73□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 CRH1YGR189C 1524 nt7.73□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 PRC1YMR297W 1599 nt7.72□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 SPE4YLR146C 903 nt7.72□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 YPR127WYPR127W 1038 nt7.72□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 MHP1YJL042W 4197 nt7.71□□□□□ -1.17
DSE3Q08729 PMP3YDR276C 168 nt7.71□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 LCL3YGL085W 825 nt7.71□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.71□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 AIM20YIL158W 615 nt7.7□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 LSC1YOR142W 990 nt7.7□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 SMX3YPR182W 261 nt7.7□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 IRC5YFR038W 2562 nt7.7□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 YKR018CYKR018C 2178 nt7.7□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 BEM1YBR200W 1656 nt7.7□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 STF1YDL130W-A 261 nt7.69□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 PRI1YIR008C 1230 nt7.69□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 MRPL19YNL185C 477 nt7.69□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 DLD1YDL174C 1764 nt7.69□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 PTC7YHR076W 1032 nt7.68□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 ILV6YCL009C 930 nt7.68□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 AIM34YMR003W 597 nt7.67□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 ENB1YOL158C 1821 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 YJL045WYJL045W 1905 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 MRPS28YDR337W 861 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 LOT6YLR011W 576 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 RPL31BYLR406C 342 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 MSG5YNL053W 1470 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 SAL1YNL083W 1485 nt7.66□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 SEC24YIL109C 2781 nt7.65□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 VBA5YKR105C 1749 nt7.65□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 MIX17YMR002W 471 nt7.65□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 SPG5YMR191W 1122 nt7.65□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 SEC62YPL094C 825 nt7.65□□□□□ -1.18
DSE3Q08729 PUS7YOR243C 2031 nt7.64□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 PRB1YEL060C 1908 nt7.64□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 OPI7YDR360W 435 nt7.64□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 YKL153WYKL153W 510 nt7.64□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 TDP1YBR223C 1635 nt7.63□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 CHA1YCL064C 1083 nt7.63□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 ASF1YJL115W 840 nt7.63□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 SCS22YBL091C-A 528 nt7.63□□□□□ -1.19
DSE3Q08729 ITR1YDR497C 1755 nt7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.1 ms