Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD300CQ08708 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD300CQ08708 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD300CQ08708 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD300CQ08708 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms