Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUDPQ08623 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUDPQ08623 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PUDPQ08623 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUDPQ08623 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms