Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 WDR73-209ENST00000559178 933 ntTSL 39.74□□□□□ -0.853e-7■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 WDR73-217ENST00000560835 582 ntTSL 29.31□□□□□ -0.923e-7■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 PIDD1-205ENST00000527357 4496 ntTSL 211.42□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 PIDD1-203ENST00000524486 3917 ntTSL 210.25□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 PIDD1-210ENST00000534525 3994 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 522.84■■□□□ 1.251e-7■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.651e-7■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 CARS-204ENST00000439280 1021 ntTSL 317.25■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 25.8
SRSF1Q07955 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.065e-10■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 PIDD1-209ENST00000531286 1937 ntTSL 216.33■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 PIDD1-206ENST00000527812 481 ntTSL 315.55■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 THOP1-213ENST00000591363 639 ntTSL 515.49■□□□□ 0.076e-12■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.046e-12■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 213.65□□□□□ -0.226e-12■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.371e-10■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 34.16□□□□□ -1.741e-10■■■■□ 25.7
SRSF1Q07955 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.995e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.975e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-207ENST00000512465 4663 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.892e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.232e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.272e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 FAM193A-209ENST00000513898 4202 ntTSL 1 (best)7.05□□□□□ -1.282e-10■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.755e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.188e-7■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC88B-204ENST00000463837 5235 ntTSL 215.71■□□□□ 0.118e-7■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.035e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 UBXN2A-203ENST00000446425 2195 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.265e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC88B-209ENST00000494080 4563 ntTSL 213.03□□□□□ -0.328e-7■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.665e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 NUP62CL-204ENST00000484614 1515 ntTSL 210.63□□□□□ -0.715e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 AC002480.1-201ENST00000442252 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.825e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC174-203ENST00000463438 751 ntTSL 29.15□□□□□ -0.945e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC174-204ENST00000465759 1139 ntTSL 1 (best)8.7□□□□□ -1.025e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.025e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC174-206ENST00000611584 2720 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.145e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 CCDC174-202ENST00000383794 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 AC002480.4-201ENST00000414116 2592 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.315e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 NUP62CL-203ENST00000432145 688 ntAPPRIS P1 TSL 53.06□□□□□ -1.925e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 MRPL16-203ENST00000531802 557 ntTSL 216.42■□□□□ 0.222e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.172e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 TIMM10B-205ENST00000533379 608 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 AC084337.2-202ENST00000640959 595 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 TIMM10B-204ENST00000531462 516 ntTSL 39.95□□□□□ -0.822e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 TIMM10B-201ENST00000254616 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-8■■■■□ 25.6
SRSF1Q07955 POLE3-204ENST00000479871 2396 ntTSL 210.85□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.831e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.041e-11■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 210.36□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)10.36□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 218.92■□□□□ 0.623e-12■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.363e-8■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-8■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.369e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 AC079781.5-203ENST00000641315 2059 nt15.69■□□□□ 0.19e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt13.98□□□□□ -0.172e-8■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.38□□□□□ -0.592e-8■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.789e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 ASNS-205ENST00000422745 1865 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.019e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.099e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.599e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 POLE-212ENST00000539215 483 ntTSL 511.89□□□□□ -0.515e-7■■■■□ 25.5
SRSF1Q07955 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 226.38■■□□□ 1.814e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.684e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 EPS8-214ENST00000544064 577 ntTSL 418.98■□□□□ 0.634e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 518.46■□□□□ 0.554e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 318.1■□□□□ 0.494e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 EPS8-205ENST00000536793 559 ntTSL 417.97■□□□□ 0.474e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 517.69■□□□□ 0.424e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.354e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 EPS8-206ENST00000536956 621 ntTSL 317.18■□□□□ 0.344e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 NCAPH2-208ENST00000522048 1069 ntTSL 216.71■□□□□ 0.274e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 NCAPH2-207ENST00000520297 539 ntTSL 516.29■□□□□ 0.24e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 515.65■□□□□ 0.14e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 315.39■□□□□ 0.054e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 315.23■□□□□ 0.034e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 214.35□□□□□ -0.114e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 314.21□□□□□ -0.134e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 CTBP1-206ENST00000504784 418 ntTSL 313.07□□□□□ -0.324e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 HCG18-246ENST00000602591 1976 nt10.18□□□□□ -0.784e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 EPS8-211ENST00000543468 3722 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.864e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.954e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -11e-6■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.461e-6■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 EPS8-204ENST00000535752 543 ntTSL 44.13□□□□□ -1.754e-8■■■■□ 25.4
SRSF1Q07955 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 216.21■□□□□ 0.198e-7■■■■□ 25.3
SRSF1Q07955 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 215.15■□□□□ 0.028e-7■■■■□ 25.3
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 241.1 ms