Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC3A1Q07837 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC3A1Q07837 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC3A1Q07837 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms