Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
EXOSC9Q06265 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EXOSC9Q06265 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EXOSC9Q06265 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EXOSC9Q06265 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms