Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 ADH6YMR318C 1083 nt6.61□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 YPR127WYPR127W 1038 nt6.61□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 AMN1YBR158W 1650 nt6.61□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 CCT3YJL014W 1605 nt6.6□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 ERS1YCR075C 783 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 ERG27YLR100W 1044 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 ERV2YPR037C 591 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 SMK1YPR054W 1167 nt6.59□□□□□ -1.35
NUP49Q02199 CEM1YER061C 1329 nt6.58□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 SKP1YDR328C 585 nt6.58□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 RPL2BYIL018W 765 nt6.58□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 IRC5YFR038W 2562 nt6.57□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 YLL066CYLL066C 3618 nt6.56□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 STS1YIR011C 960 nt6.56□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 CCW12YLR110C 402 nt6.56□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 MIX17YMR002W 471 nt6.56□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 HBN1YCL026C-B 582 nt6.56□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 YJL213WYJL213W 996 nt6.55□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 RPL43AYPR043W 279 nt6.55□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 TOS1YBR162C 1368 nt6.55□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 MSG5YNL053W 1470 nt6.54□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 YBR241CYBR241C 1467 nt6.54□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 MRPL28YDR462W 444 nt6.54□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 YAL045CYAL045C 309 nt6.54□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 YOR343CYOR343C 327 nt6.54□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 OSM1YJR051W 1506 nt6.54□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 DLD1YDL174C 1764 nt6.54□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 YCR061WYCR061W 1896 nt6.53□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 THR1YHR025W 1074 nt6.53□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 CRN1YLR429W 1956 nt6.53□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 YHR131CYHR131C 2553 nt6.53□□□□□ -1.36
NUP49Q02199 HEL1YKR017C 1656 nt6.52□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 CTA1YDR256C 1548 nt6.52□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 YDR476CYDR476C 675 nt6.52□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 PET117YER058W 324 nt6.52□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 FUS3YBL016W 1062 nt6.52□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 OPI11YPR044C 354 nt6.52□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 SLA2YNL243W 2907 nt6.52□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 RSP5YER125W 2430 nt6.51□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 DMC1YER179W 1005 nt6.51□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 YNR014WYNR014W 639 nt6.51□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 HRB1YNL004W 1365 nt6.51□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 SMC5YOL034W 3282 nt6.51□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 YJR142WYJR142W 1029 nt6.5□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 SKY1YMR216C 2229 nt6.49□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 PIL1YGR086C 1020 nt6.49□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 NCA3YJL116C 1014 nt6.49□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 SDH8YBR269C 417 nt6.49□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 ECM38YLR299W 1983 nt6.49□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 AGP2YBR132C 1791 nt6.49□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 DAL7YIR031C 1665 nt6.49□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 BDF2YDL070W 1917 nt6.48□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 ARP3YJR065C 1350 nt6.48□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 HPT1YDR399W 666 nt6.48□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 COX16YJL003W 357 nt6.48□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 BUD20YLR074C 501 nt6.48□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 YOL099CYOL099C 492 nt6.48□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 CIT2YCR005C 1383 nt6.47□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 OPI8YKR035C 642 nt6.47□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.47□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.47□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.47□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.47□□□□□ -1.37
NUP49Q02199 NMA2YGR010W 1188 nt6.46□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 SUR7YML052W 909 nt6.46□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 PET494YNR045W 1470 nt6.46□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 ACO1YLR304C 2337 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 PAC2YER007W 1557 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 PPH22YDL188C 1134 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 HSP12YFL014W 330 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 CTF8YHR191C 402 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 MSI1YBR195C 1269 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 CLN1YMR199W 1641 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 HOG1YLR113W 1308 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 TUF1YOR187W 1314 nt6.45□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 YCR049CYCR049C 447 nt6.44□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.44□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 DPM1YPR183W 804 nt6.44□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 EMP65YER140W 1671 nt6.44□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 RGD2YFL047W 2145 nt6.44□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 VTS1YOR359W 1572 nt6.44□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 YGL081WYGL081W 963 nt6.43□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 ERG12YMR208W 1332 nt6.42□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 RTC4YNL254C 1206 nt6.41□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 RPL5YPL131W 894 nt6.41□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 TRS31YDR472W 852 nt6.4□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 BIM1YER016W 1035 nt6.4□□□□□ -1.38
NUP49Q02199 YPL247CYPL247C 1572 nt6.4□□□□□ -1.39
NUP49Q02199 EDC2YER035W 438 nt6.39□□□□□ -1.39
NUP49Q02199 DOC1YGL240W 753 nt6.39□□□□□ -1.39
NUP49Q02199 MGM101YJR144W 810 nt6.39□□□□□ -1.39
NUP49Q02199 YLR358CYLR358C 564 nt6.39□□□□□ -1.39
NUP49Q02199 PEX31YGR004W 1389 nt6.39□□□□□ -1.39
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