Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD4Q01804 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTUD4Q01804 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTUD4Q01804 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUD4Q01804 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms