Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCN7AQ01118 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCN7AQ01118 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN7AQ01118 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SCN7AQ01118 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms