Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRCDQ00LT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRCDQ00LT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRCDQ00LT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRCDQ00LT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms