Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC5Q00444 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC5Q00444 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC5Q00444 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms