Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT83P78385 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT83P78385 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT83P78385 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT83P78385 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT83P78385 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT83P78385 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT83P78385 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT83P78385 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT83P78385 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT83P78385 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT83P78385 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT83P78385 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT83P78385 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT83P78385 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT83P78385 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT83P78385 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT83P78385 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT83P78385 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT83P78385 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT83P78385 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT83P78385 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT83P78385 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT83P78385 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT83P78385 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT83P78385 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT83P78385 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT83P78385 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT83P78385 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT83P78385 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT83P78385 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT83P78385 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT83P78385 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT83P78385 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT83P78385 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT83P78385 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT83P78385 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT83P78385 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT83P78385 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT83P78385 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT83P78385 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT83P78385 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT83P78385 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT83P78385 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT83P78385 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT83P78385 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT83P78385 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT83P78385 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT83P78385 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT83P78385 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT83P78385 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT83P78385 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT83P78385 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT83P78385 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT83P78385 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT83P78385 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT83P78385 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT83P78385 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT83P78385 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT83P78385 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT83P78385 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT83P78385 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT83P78385 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT83P78385 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT83P78385 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT83P78385 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT83P78385 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT83P78385 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT83P78385 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT83P78385 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT83P78385 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT83P78385 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT83P78385 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT83P78385 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT83P78385 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT83P78385 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT83P78385 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT83P78385 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT83P78385 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT83P78385 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT83P78385 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT83P78385 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT83P78385 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT83P78385 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT83P78385 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms