Protein–RNA interactions for Protein: P78382

SLC35A1, CMP-sialic acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A1P78382 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35A1P78382 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35A1P78382 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35A1P78382 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms