Protein–RNA interactions for Protein: P63010

AP2B1, AP-2 complex subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2B1P63010 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP2B1P63010 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP2B1P63010 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP2B1P63010 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2B1P63010 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms