Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS28P62857 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS28P62857 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS28P62857 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS28P62857 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS28P62857 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS28P62857 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS28P62857 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS28P62857 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS28P62857 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS28P62857 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPS28P62857 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS28P62857 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS28P62857 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS28P62857 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS28P62857 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RPS28P62857 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS28P62857 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS28P62857 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS28P62857 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS28P62857 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS28P62857 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS28P62857 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS28P62857 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS28P62857 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS28P62857 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS28P62857 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS28P62857 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS28P62857 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS28P62857 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS28P62857 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS28P62857 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS28P62857 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPS28P62857 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RPS28P62857 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS28P62857 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS28P62857 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS28P62857 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS28P62857 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS28P62857 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS28P62857 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS28P62857 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS28P62857 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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