Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BACE1P56817 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
BACE1P56817 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BACE1P56817 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BACE1P56817 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BACE1P56817 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BACE1P56817 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BACE1P56817 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BACE1P56817 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BACE1P56817 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
BACE1P56817 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BACE1P56817 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BACE1P56817 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BACE1P56817 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BACE1P56817 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BACE1P56817 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BACE1P56817 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BACE1P56817 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BACE1P56817 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BACE1P56817 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BACE1P56817 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BACE1P56817 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BACE1P56817 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BACE1P56817 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BACE1P56817 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BACE1P56817 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BACE1P56817 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BACE1P56817 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BACE1P56817 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BACE1P56817 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BACE1P56817 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BACE1P56817 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BACE1P56817 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BACE1P56817 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
BACE1P56817 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BACE1P56817 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BACE1P56817 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BACE1P56817 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BACE1P56817 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BACE1P56817 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BACE1P56817 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BACE1P56817 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BACE1P56817 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BACE1P56817 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BACE1P56817 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BACE1P56817 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BACE1P56817 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BACE1P56817 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BACE1P56817 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BACE1P56817 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BACE1P56817 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BACE1P56817 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BACE1P56817 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BACE1P56817 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BACE1P56817 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BACE1P56817 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BACE1P56817 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BACE1P56817 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BACE1P56817 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BACE1P56817 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BACE1P56817 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BACE1P56817 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BACE1P56817 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BACE1P56817 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BACE1P56817 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BACE1P56817 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BACE1P56817 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BACE1P56817 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BACE1P56817 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BACE1P56817 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BACE1P56817 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BACE1P56817 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BACE1P56817 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BACE1P56817 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BACE1P56817 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BACE1P56817 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BACE1P56817 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BACE1P56817 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BACE1P56817 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BACE1P56817 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BACE1P56817 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BACE1P56817 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BACE1P56817 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BACE1P56817 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BACE1P56817 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms