Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMP1P54849 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMP1P54849 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMP1P54849 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMP1P54849 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMP1P54849 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMP1P54849 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMP1P54849 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMP1P54849 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMP1P54849 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMP1P54849 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMP1P54849 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EMP1P54849 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EMP1P54849 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMP1P54849 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMP1P54849 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMP1P54849 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMP1P54849 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMP1P54849 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMP1P54849 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMP1P54849 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMP1P54849 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMP1P54849 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMP1P54849 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMP1P54849 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMP1P54849 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMP1P54849 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMP1P54849 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMP1P54849 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMP1P54849 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMP1P54849 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMP1P54849 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMP1P54849 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMP1P54849 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMP1P54849 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMP1P54849 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMP1P54849 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMP1P54849 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMP1P54849 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMP1P54849 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMP1P54849 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMP1P54849 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMP1P54849 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMP1P54849 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMP1P54849 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms