Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD23BP54727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD23BP54727 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD23BP54727 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms