Protein–RNA interactions for Protein: P54578

USP14, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP14P54578 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP14P54578 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP14P54578 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP14P54578 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP14P54578 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP14P54578 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP14P54578 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP14P54578 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP14P54578 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP14P54578 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP14P54578 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP14P54578 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP14P54578 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP14P54578 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP14P54578 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP14P54578 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP14P54578 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP14P54578 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP14P54578 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP14P54578 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP14P54578 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP14P54578 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP14P54578 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP14P54578 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP14P54578 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP14P54578 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP14P54578 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP14P54578 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP14P54578 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP14P54578 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP14P54578 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP14P54578 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP14P54578 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
USP14P54578 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP14P54578 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP14P54578 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP14P54578 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP14P54578 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP14P54578 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP14P54578 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP14P54578 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP14P54578 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP14P54578 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP14P54578 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP14P54578 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP14P54578 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP14P54578 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP14P54578 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP14P54578 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP14P54578 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP14P54578 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP14P54578 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP14P54578 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP14P54578 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP14P54578 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP14P54578 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP14P54578 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP14P54578 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP14P54578 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP14P54578 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP14P54578 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP14P54578 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP14P54578 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP14P54578 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP14P54578 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP14P54578 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP14P54578 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP14P54578 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP14P54578 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP14P54578 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP14P54578 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP14P54578 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP14P54578 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP14P54578 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP14P54578 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP14P54578 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP14P54578 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP14P54578 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP14P54578 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP14P54578 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP14P54578 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP14P54578 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP14P54578 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP14P54578 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms