Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATXN3P54252 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATXN3P54252 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATXN3P54252 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATXN3P54252 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms