Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RARSP54136 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RARSP54136 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RARSP54136 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RARSP54136 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RARSP54136 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RARSP54136 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RARSP54136 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RARSP54136 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RARSP54136 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RARSP54136 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RARSP54136 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RARSP54136 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RARSP54136 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RARSP54136 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RARSP54136 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RARSP54136 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RARSP54136 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RARSP54136 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RARSP54136 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RARSP54136 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RARSP54136 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RARSP54136 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RARSP54136 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RARSP54136 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RARSP54136 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RARSP54136 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RARSP54136 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RARSP54136 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RARSP54136 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RARSP54136 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RARSP54136 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RARSP54136 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RARSP54136 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RARSP54136 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RARSP54136 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RARSP54136 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RARSP54136 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RARSP54136 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RARSP54136 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RARSP54136 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RARSP54136 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RARSP54136 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RARSP54136 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RARSP54136 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RARSP54136 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RARSP54136 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RARSP54136 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RARSP54136 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RARSP54136 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RARSP54136 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RARSP54136 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RARSP54136 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RARSP54136 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RARSP54136 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RARSP54136 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RARSP54136 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RARSP54136 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RARSP54136 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RARSP54136 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RARSP54136 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RARSP54136 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RARSP54136 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RARSP54136 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RARSP54136 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RARSP54136 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RARSP54136 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RARSP54136 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RARSP54136 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARSP54136 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RARSP54136 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RARSP54136 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RARSP54136 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RARSP54136 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RARSP54136 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RARSP54136 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RARSP54136 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RARSP54136 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RARSP54136 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RARSP54136 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RARSP54136 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RARSP54136 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RARSP54136 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RARSP54136 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RARSP54136 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
RARSP54136 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.3 ms