Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LIMK1P53667 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIMK1P53667 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIMK1P53667 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms