Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOSBP53539 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOSBP53539 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSBP53539 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FOSBP53539 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FOSBP53539 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOSBP53539 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOSBP53539 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOSBP53539 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FOSBP53539 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOSBP53539 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOSBP53539 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOSBP53539 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOSBP53539 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOSBP53539 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOSBP53539 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FOSBP53539 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOSBP53539 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOSBP53539 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOSBP53539 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSBP53539 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSBP53539 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSBP53539 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSBP53539 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSBP53539 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSBP53539 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSBP53539 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSBP53539 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSBP53539 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSBP53539 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSBP53539 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOSBP53539 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOSBP53539 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOSBP53539 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSBP53539 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSBP53539 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSBP53539 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSBP53539 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSBP53539 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSBP53539 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOSBP53539 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOSBP53539 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOSBP53539 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOSBP53539 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOSBP53539 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSBP53539 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSBP53539 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSBP53539 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSBP53539 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOSBP53539 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOSBP53539 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOSBP53539 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOSBP53539 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOSBP53539 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOSBP53539 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOSBP53539 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSBP53539 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSBP53539 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSBP53539 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSBP53539 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSBP53539 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSBP53539 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSBP53539 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSBP53539 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSBP53539 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSBP53539 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSBP53539 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOSBP53539 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FOSBP53539 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOSBP53539 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSBP53539 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSBP53539 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSBP53539 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSBP53539 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOSBP53539 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOSBP53539 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOSBP53539 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FOSBP53539 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOSBP53539 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOSBP53539 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOSBP53539 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOSBP53539 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOSBP53539 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms