Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP98P52948 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP98P52948 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP98P52948 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP98P52948 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP98P52948 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NUP98P52948 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NUP98P52948 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NUP98P52948 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP98P52948 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP98P52948 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP98P52948 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP98P52948 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP98P52948 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP98P52948 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP98P52948 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP98P52948 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP98P52948 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP98P52948 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NUP98P52948 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP98P52948 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP98P52948 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NUP98P52948 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP98P52948 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP98P52948 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NUP98P52948 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NUP98P52948 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP98P52948 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP98P52948 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP98P52948 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NUP98P52948 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP98P52948 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP98P52948 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP98P52948 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP98P52948 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP98P52948 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP98P52948 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP98P52948 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NUP98P52948 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP98P52948 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP98P52948 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP98P52948 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP98P52948 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP98P52948 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP98P52948 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP98P52948 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP98P52948 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP98P52948 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP98P52948 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP98P52948 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP98P52948 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP98P52948 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP98P52948 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP98P52948 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP98P52948 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP98P52948 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP98P52948 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP98P52948 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP98P52948 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP98P52948 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP98P52948 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP98P52948 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP98P52948 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP98P52948 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP98P52948 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP98P52948 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP98P52948 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NUP98P52948 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP98P52948 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP98P52948 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP98P52948 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP98P52948 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP98P52948 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP98P52948 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP98P52948 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP98P52948 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP98P52948 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP98P52948 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP98P52948 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP98P52948 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUP98P52948 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUP98P52948 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUP98P52948 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NUP98P52948 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
NUP98P52948 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUP98P52948 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUP98P52948 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUP98P52948 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUP98P52948 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUP98P52948 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUP98P52948 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUP98P52948 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms