Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMSP52788 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMSP52788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMSP52788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMSP52788 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMSP52788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMSP52788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMSP52788 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMSP52788 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMSP52788 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMSP52788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMSP52788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMSP52788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMSP52788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMSP52788 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMSP52788 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMSP52788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMSP52788 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMSP52788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMSP52788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMSP52788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMSP52788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMSP52788 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMSP52788 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMSP52788 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMSP52788 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMSP52788 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMSP52788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMSP52788 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMSP52788 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMSP52788 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMSP52788 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMSP52788 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMSP52788 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMSP52788 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMSP52788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMSP52788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMSP52788 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMSP52788 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMSP52788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMSP52788 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMSP52788 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMSP52788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMSP52788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMSP52788 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMSP52788 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMSP52788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMSP52788 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMSP52788 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMSP52788 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMSP52788 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMSP52788 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMSP52788 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMSP52788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMSP52788 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMSP52788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMSP52788 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMSP52788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMSP52788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMSP52788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMSP52788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMSP52788 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMSP52788 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMSP52788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMSP52788 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMSP52788 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMSP52788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMSP52788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMSP52788 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMSP52788 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMSP52788 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMSP52788 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMSP52788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMSP52788 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMSP52788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMSP52788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMSP52788 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMSP52788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMSP52788 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMSP52788 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMSP52788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMSP52788 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMSP52788 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms