Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF135P52742 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF135P52742 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF135P52742 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms