Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCNN1GP51170 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCNN1GP51170 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCNN1GP51170 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCNN1GP51170 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms