Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK7P50613 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK7P50613 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK7P50613 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK7P50613 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK7P50613 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK7P50613 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK7P50613 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK7P50613 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK7P50613 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK7P50613 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK7P50613 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK7P50613 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK7P50613 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK7P50613 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK7P50613 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK7P50613 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK7P50613 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK7P50613 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK7P50613 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK7P50613 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK7P50613 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK7P50613 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK7P50613 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK7P50613 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK7P50613 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK7P50613 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK7P50613 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK7P50613 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK7P50613 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK7P50613 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK7P50613 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK7P50613 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK7P50613 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK7P50613 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK7P50613 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK7P50613 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK7P50613 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK7P50613 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK7P50613 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK7P50613 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK7P50613 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK7P50613 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK7P50613 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK7P50613 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK7P50613 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK7P50613 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK7P50613 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK7P50613 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK7P50613 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK7P50613 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK7P50613 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK7P50613 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK7P50613 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK7P50613 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK7P50613 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK7P50613 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK7P50613 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK7P50613 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK7P50613 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK7P50613 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK7P50613 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK7P50613 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK7P50613 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK7P50613 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK7P50613 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK7P50613 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK7P50613 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK7P50613 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK7P50613 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK7P50613 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK7P50613 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK7P50613 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK7P50613 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK7P50613 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK7P50613 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK7P50613 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK7P50613 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK7P50613 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK7P50613 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms