Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRP3P50461 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRP3P50461 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRP3P50461 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRP3P50461 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRP3P50461 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms