Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3AP50213 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IDH3AP50213 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IDH3AP50213 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IDH3AP50213 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IDH3AP50213 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IDH3AP50213 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IDH3AP50213 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IDH3AP50213 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IDH3AP50213 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms