Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK3P49761 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK3P49761 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK3P49761 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK3P49761 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK3P49761 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK3P49761 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK3P49761 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK3P49761 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK3P49761 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK3P49761 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK3P49761 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK3P49761 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK3P49761 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK3P49761 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK3P49761 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK3P49761 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK3P49761 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK3P49761 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK3P49761 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK3P49761 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK3P49761 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK3P49761 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK3P49761 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK3P49761 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK3P49761 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK3P49761 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK3P49761 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK3P49761 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK3P49761 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK3P49761 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK3P49761 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK3P49761 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK3P49761 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK3P49761 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK3P49761 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK3P49761 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK3P49761 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK3P49761 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK3P49761 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK3P49761 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLK3P49761 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLK3P49761 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK3P49761 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK3P49761 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK3P49761 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK3P49761 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK3P49761 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK3P49761 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK3P49761 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK3P49761 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK3P49761 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK3P49761 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK3P49761 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK3P49761 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK3P49761 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK3P49761 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms