Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK1P49759 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK1P49759 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK1P49759 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLK1P49759 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK1P49759 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK1P49759 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK1P49759 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK1P49759 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK1P49759 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK1P49759 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK1P49759 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK1P49759 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK1P49759 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK1P49759 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK1P49759 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK1P49759 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK1P49759 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK1P49759 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK1P49759 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK1P49759 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK1P49759 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK1P49759 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK1P49759 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK1P49759 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK1P49759 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK1P49759 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK1P49759 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK1P49759 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK1P49759 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK1P49759 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK1P49759 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK1P49759 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK1P49759 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK1P49759 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK1P49759 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK1P49759 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK1P49759 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK1P49759 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK1P49759 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK1P49759 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK1P49759 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK1P49759 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK1P49759 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK1P49759 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK1P49759 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK1P49759 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK1P49759 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK1P49759 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK1P49759 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK1P49759 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK1P49759 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK1P49759 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK1P49759 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK1P49759 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK1P49759 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK1P49759 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK1P49759 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK1P49759 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms